福建農(nóng)林大學金山學院總共有29個專業(yè)。

福建農(nóng)林大學金山學院本科專業(yè)有22個：農(nóng)學、植物保護（植物檢疫方向）、計算機科學與技術(shù)、林學、電子信息工程、國際經(jīng)濟與貿(mào)易、電子科學與技術(shù)、財務管理、工商管理、食品質(zhì)量與安全、人力資源管理、行政管理、食品科學與工程、旅游管理、化學工程與工藝、工程管理、土木工程、電氣工程及其自動化、機械設計制造及其自動化、英語、廣告學、藝術(shù)設計。

福建農(nóng)林大學金山學院其他專業(yè)有7個：交通工程、公共事業(yè)管理、農(nóng)村區(qū)域發(fā)展、園藝、園林、動物醫(yī)學、植物保護。