菏澤學(xué)院總共有39個專業(yè)。

菏澤學(xué)院本科專業(yè)有29個：歷史學(xué)、食品科學(xué)與工程、自動化、機(jī)械電子工程、計算機(jī)科學(xué)與技術(shù)、化學(xué)工程與工藝、學(xué)前教育、漢語言文學(xué)、生物工程、小學(xué)教育、英語、網(wǎng)絡(luò)工程、信息與計算科學(xué)、日語、農(nóng)學(xué)、動物醫(yī)學(xué)、資源環(huán)境與城鄉(xiāng)規(guī)劃管理、廣播電視新聞學(xué)、數(shù)學(xué)與應(yīng)用數(shù)學(xué)、園林、財務(wù)管理、物理學(xué)、勞動與社會保障、物流管理、思想政治教育、化學(xué)、生物科學(xué)、電子信息科學(xué)與技術(shù)、心理學(xué)。

菏澤學(xué)院其他專業(yè)有10個：經(jīng)濟(jì)學(xué)、化學(xué)、機(jī)械、生物工程、廣告學(xué)、工商管理、數(shù)學(xué)、制藥工程、動物生物技術(shù)、特殊教育。