吉林農(nóng)業(yè)科技學(xué)院總共有60個專業(yè)。

吉林農(nóng)業(yè)科技學(xué)院本科專業(yè)有48個：食品加工技術(shù)、食品營養(yǎng)與檢測、食品生物技術(shù)、醫(yī)藥營銷、計算機應(yīng)用技術(shù)、網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)管理、生物制藥技術(shù)、生物技術(shù)及應(yīng)用、水利工程、中草藥栽培與鑒定、生物工程、工商管理、餐飲管理與服務(wù)、市場營銷、中藥學(xué)、烹飪與營養(yǎng)教育、農(nóng)業(yè)建筑環(huán)境與能源工程、中藥、生物技術(shù)、中藥資源與開發(fā)、統(tǒng)計學(xué)、機械制造與自動化、藥物制劑、園藝、包裝工程、中草藥栽培技術(shù)、動植物檢疫、機械設(shè)計制造及其自動化、畜牧獸醫(yī)、電子信息科學(xué)與技術(shù)、植物保護(hù)、獸醫(yī)、應(yīng)用化學(xué)、作物生產(chǎn)技術(shù)、野生動物與自然保護(hù)區(qū)管理、英語、計算機科學(xué)與技術(shù)、動物醫(yī)學(xué)、朝鮮語、制藥工程、園林技術(shù)、植物科學(xué)與技術(shù)、特種動物養(yǎng)殖、食品科學(xué)與工程、食品質(zhì)量與安全、動物科學(xué)、園林、植物生產(chǎn)。

吉林農(nóng)業(yè)科技學(xué)院專科專業(yè)有5個：園藝技術(shù)、會計電算化、物流管理、工商企業(yè)管理、商務(wù)英語。

吉林農(nóng)業(yè)科技學(xué)院其他專業(yè)有7個：國際經(jīng)濟(jì)與貿(mào)易、水利水電工程、電氣工程及其自動化、網(wǎng)絡(luò)工程、財務(wù)管理、動物生物技術(shù)、國際經(jīng)濟(jì)與貿(mào)易。