吉林農(nóng)業(yè)科技學院總共有60個專業(yè)。

吉林農(nóng)業(yè)科技學院本科專業(yè)有48個：食品加工技術、食品營養(yǎng)與檢測、食品生物技術、醫(yī)藥營銷、計算機應用技術、網(wǎng)絡系統(tǒng)管理、生物制藥技術、生物技術及應用、水利工程、中草藥栽培與鑒定、生物工程、工商管理、餐飲管理與服務、市場營銷、中藥學、烹飪與營養(yǎng)教育、農(nóng)業(yè)建筑環(huán)境與能源工程、中藥、生物技術、中藥資源與開發(fā)、統(tǒng)計學、機械制造與自動化、藥物制劑、園藝、包裝工程、中草藥栽培技術、動植物檢疫、機械設計制造及其自動化、畜牧獸醫(yī)、電子信息科學與技術、植物保護、獸醫(yī)、應用化學、作物生產(chǎn)技術、野生動物與自然保護區(qū)管理、英語、計算機科學與技術、動物醫(yī)學、朝鮮語、制藥工程、園林技術、植物科學與技術、特種動物養(yǎng)殖、食品科學與工程、食品質(zhì)量與安全、動物科學、園林、植物生產(chǎn)。

吉林農(nóng)業(yè)科技學院專科專業(yè)有5個：園藝技術、會計電算化、物流管理、工商企業(yè)管理、商務英語。

吉林農(nóng)業(yè)科技學院其他專業(yè)有7個：國際經(jīng)濟與貿(mào)易、水利水電工程、電氣工程及其自動化、網(wǎng)絡工程、財務管理、動物生物技術、國際經(jīng)濟與貿(mào)易。