吉林工商學院總共有44個專業(yè)。

吉林工商學院本科專業(yè)有29個：生物工程、機械電子工程、財務管理、食品科學與工程、會計學、人力資源管理、網絡工程、糧食工程、動物科學、工程管理、國際經濟與貿易、機械設計制造及其自動化、審計學、英語（經貿英語）、財政學、動畫、經濟學、電子信息工程、金融學、廣告學、計算機科學與技術、食品質量與安全、日語、食品營養(yǎng)與檢驗教育、旅游管理、烹飪與營養(yǎng)教育、工商管理、過程裝備與控制工程、市場營銷。

吉林工商學院?？茖I(yè)有13個：食品加工技術、國際貿易實務、會計、物業(yè)管理、資產評估與管理、金融管理與實務、物流管理、新聞采編與制作、計算機網絡技術、烹飪工藝與營養(yǎng)、酒店管理、商務英語、商務日語。

吉林工商學院其他專業(yè)有2個：稅務、保險。