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云南中醫(yī)藥大學2021在全國本科院校排名第553位，強于第554名的新鄉(xiāng)學院，第555名的陜西中醫(yī)藥大學，第556名的湖南第一師范學院，第557名的黃山學院，第558名的太原師范學院。在云南排第11名，強于第12名的昆明學院，第13名的曲靖師范學院，第14名的紅河學院，第15名的玉溪師范學院，第16名的滇西科技師范學院。

綜合實力排名（校友會版）

在全國本科院校排名第410位，在云南排第14名。

綜合實力排名（軟科版）

在全國本科院校排名第337位，在云南排第7名。