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福建中醫(yī)藥大學2021在全國本科院校排名第404位，強于第405名的湖南工商大學，第406名的南寧師范大學，第407名的魯迅美術學院，第408名的云南民族大學，第409名的洛陽理工學院。在福建排第10名，強于第11名的閩南師范大學，第12名的閩江學院，第13名的泉州師范學院，第14名的福建江夏學院，第15名的廈門大學嘉庚學院。

綜合實力排名（校友會版）

在全國本科院校排名第250位，在福建排第8名。

綜合實力排名（軟科版）

在全國本科院校排名第258位，在福建排第9名。