上海中醫(yī)藥大學(xué)總共有31個專業(yè)。

上海中醫(yī)藥大學(xué)本科專業(yè)有30個：中西醫(yī)臨床醫(yī)學(xué)、護(hù)理學(xué)、藥學(xué)、中醫(yī)學(xué)、中醫(yī)學(xué)(基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)方向)、康復(fù)治療學(xué)、中醫(yī)學(xué)(臨床方向)、中醫(yī)學(xué)(針灸推拿英語班)、藥學(xué)類（中外）、基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)、中藥學(xué)、中醫(yī)學(xué)(中醫(yī)方向)、針灸推拿學(xué)、中醫(yī)學(xué)(骨傷方向)、中醫(yī)學(xué)、康復(fù)治療學(xué)(中西醫(yī)結(jié)合方向男)、康復(fù)治療學(xué)(中西醫(yī)結(jié)合方向女)、藥學(xué)、中藥制藥技術(shù)(本部)、營養(yǎng)學(xué)、公共事業(yè)管理、醫(yī)學(xué)營養(yǎng)(中醫(yī)營養(yǎng)方向)、醫(yī)療美容技術(shù)(中醫(yī)美容方向)、運動人體科學(xué)、康復(fù)治療技術(shù)(老年管理與服務(wù)方向)、護(hù)理(中外合作)、護(hù)理(中西醫(yī)結(jié)合)、護(hù)理(梅隴教學(xué)分部)、醫(yī)學(xué)營養(yǎng)(營養(yǎng)與衛(wèi)生方向)、康復(fù)治療學(xué)(中西醫(yī)結(jié)合方向)。

上海中醫(yī)藥大學(xué)其他專業(yè)有1個：藥學(xué)類（中外合作辦學(xué)）。