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牡丹江醫(yī)學院2021在全國本科院校排名第690位，強于第691名的池州學院，第692名的漢口學院，第693名的喀什大學，第694名的寧德師范學院，第695名的滇西科技師范學院。在黑龍江排第21名，強于第22名的齊齊哈爾醫(yī)學院，第23名的黑河學院，第24名的黑龍江東方學院，第25名的大慶師范學院，第26名的綏化學院。

綜合實力排名（校友會版）

在全國本科院校排名第560位，在黑龍江排第23名。

綜合實力排名（軟科版）

在全國本科院校排名第391位，在黑龍江排第13名。