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福建醫(yī)科大學2021在全國本科院校排名第300位，強于第301名的內蒙古科技大學，第302名的大連大學，第303名的景德鎮(zhèn)陶瓷大學，第304名的中國人民公安大學，第305名的武漢工程大學。在福建排第7名，強于第8名的廈門理工學院，第9名的福建工程學院，第10名的福建中醫(yī)藥大學，第11名的閩南師范大學，第12名的閩江學院。

綜合實力排名（校友會版）

在全國本科院校排名第245位，在福建排第7名。

綜合實力排名（軟科版）

在全國本科院校排名第154位，在福建排第4名。