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哈爾濱醫(yī)科大學2021在全國本科院校排名第145位，強于第146名的第二軍醫(yī)大學，第147名的中國美術學院，第148名的溫州醫(yī)科大學，第149名的中國音樂學院，第150名的重慶郵電大學。在黑龍江排第6名，強于第7名的哈爾濱理工大學，第8名的東北石油大學，第9名的哈爾濱師范大學，第10名的黑龍江中醫(yī)藥大學，第11名的哈爾濱商業(yè)大學。

綜合實力排名（校友會版）

在全國本科院校排名第105位，在黑龍江排第3名。

綜合實力排名（軟科版）

在全國本科院校排名第117位，在黑龍江排第3名。