生物工程專業(yè)師資力量雄厚，教學條件優(yōu)越。
本專業(yè)現(xiàn)有教師28名，全部具有博士學位，其中正教授9名，副教授5名，其中博士生導師5名，中國科學院院士1名，校特聘教授1名，國外兼職教授2名，其中所有正教授均有國外留學經歷。
本專業(yè)設有生物化學與分子生物學、生物化工兩個碩士點。
培養(yǎng)目標本專業(yè)主要培養(yǎng)具有扎實生命科學基本知識和實驗操作技能，并掌握現(xiàn)代生物技術及其產業(yè)化的科學原理、工藝過程和生物工程設計等基礎理論、基本技能，能從事生物工程專業(yè)相關的科學研究、技術開發(fā)和生物工程生產管理等工作的高級復合型人才。
主要課程本專業(yè)的課程設置既體現(xiàn)專業(yè)特色，又充分考慮到學生畢業(yè)走向社會的現(xiàn)實需要，即：人文素養(yǎng)、科學研究素養(yǎng)、實踐能力培養(yǎng)和創(chuàng)新精神培養(yǎng)的有機統(tǒng)一。
除本科公共課程之外，主要的基礎課和專業(yè)課程有：生物化學、微生物學、遺傳學、細胞生物學、分子生物學、生物工藝學、生物過程與設備、生物信息素養(yǎng)、基因工程、酶工程、生物分離工程等課程。
實踐環(huán)節(jié)生物工程是一個實踐性極強的專業(yè)，為了全面培養(yǎng)學生實踐實驗能力，本專業(yè)開設有公共基礎課配套的實驗外，還開設有：生物化學實驗、微生物學實驗、分子生物學實驗、發(fā)酵工程實驗、生物化學大型實驗、微生物學大型實驗、生物工程大型實驗、生物工程工藝設計、認識實習、生產實習和畢業(yè)設計等。
專業(yè)特色生物工程專業(yè)是東華大學為適應經濟發(fā)展需要而重點發(fā)展和建設的學科，該專業(yè)集生命科學、生物工程、紡織、材料等學科于一體，在蛋白質組、基因表達與調控、功能基因組、酶制劑、生物醫(yī)用功能材料、紡織生物技術、海洋功能微生物等方向正在形成學科優(yōu)勢。
本專業(yè)現(xiàn)有針對本科生進行實驗教學的實驗室面積500余平方米，擁有涵蓋生物工程上、中、下游的實驗儀器設備價值900余萬元。
就業(yè)去向和就業(yè)率學生通過四年系統(tǒng)全面的學習，畢業(yè)后可在生物工程、紡織、輕工、化工、食品、醫(yī)藥、農業(yè)等行業(yè)的高等院校、科研院所和企事業(yè)單位從事教學科研、技術開發(fā)、管理與營銷，也可在環(huán)境保護、衛(wèi)生防疫、商檢等部門從事質檢工作，也可選擇繼續(xù)深造。
目前畢業(yè)生主要就業(yè)地點在上海，就業(yè)單位是生物工程相關的科研院所和企事業(yè)單位，如:上海市環(huán)境監(jiān)測中心、上海生物制品研究所、上海農業(yè)研究所以及位于浦東的大型制藥公司和生物工程公司。
近三分之一的畢業(yè)生選擇赴國外繼續(xù)深造。