新疆農(nóng)業(yè)職業(yè)技術(shù)學(xué)院總共有49個專業(yè)。

新疆農(nóng)業(yè)職業(yè)技術(shù)學(xué)院專科專業(yè)有49個：食品營養(yǎng)與檢測、農(nóng)畜特產(chǎn)品加工、食品機(jī)械與管理、食品加工技術(shù)、會計（國際方向）、會計與審計、會計與審計(納稅籌劃)、營銷與策劃、連鎖經(jīng)營管理、物流管理、物聯(lián)網(wǎng)應(yīng)用技術(shù)、會展策劃與管理、設(shè)施農(nóng)業(yè)技術(shù)、會計與審計（中馬合作辦學(xué)）、生物技術(shù)及應(yīng)用、農(nóng)產(chǎn)品質(zhì)量檢測、廣告設(shè)計與制作（藝術(shù)類專業(yè)）、旅游英語、種子生產(chǎn)與經(jīng)營、生物制藥技術(shù)、電腦藝術(shù)設(shè)計（藝術(shù)類專業(yè)）、商務(wù)英語、計算機(jī)應(yīng)用技術(shù)、商務(wù)管理（中亞貿(mào)易方向）、畜牧獸醫(yī)、藥品質(zhì)量檢測技術(shù)、動物防疫與檢疫、建筑工程技術(shù)、信息安全技術(shù)、環(huán)境工程技術(shù)、獸醫(yī)（動物醫(yī)學(xué)）、工程造價、計算機(jī)網(wǎng)絡(luò)技術(shù)、獸醫(yī)（寵物保?。?、城市檢測與工程技術(shù)、園林工程技術(shù)、軟件技術(shù)、畜牧獸醫(yī)（現(xiàn)代馬產(chǎn)業(yè)技術(shù)）、計算機(jī)信息管理、機(jī)電一體化技術(shù)、水利工程、動漫設(shè)計與制作、園藝技術(shù)、汽車檢測與維修技術(shù)、酒店管理（中馬合作辦學(xué)）、植物保護(hù)、農(nóng)業(yè)機(jī)械應(yīng)用技術(shù)、酒店管理、涉外旅游。