云南農(nóng)業(yè)大學(xué)總共有73個(gè)專(zhuān)業(yè)。

云南農(nóng)業(yè)大學(xué)本科專(zhuān)業(yè)有65個(gè)：電氣工程及其自動(dòng)化、建筑環(huán)境與設(shè)備工程、風(fēng)景園林、農(nóng)業(yè)水利工程、森林資源保護(hù)與游憩、土木工程（高職本科）、草業(yè)科學(xué)、農(nóng)業(yè)建筑環(huán)境與能源工程、給排水科學(xué)與工程、農(nóng)業(yè)機(jī)械化及其自動(dòng)化、建筑環(huán)境與能源應(yīng)用工程、食品質(zhì)量與安全、煙草、種子科學(xué)與工程、食品科學(xué)與工程、中草藥栽培與鑒定、茶學(xué)、蠶學(xué)、食品科學(xué)與工程（蜂學(xué)及蜂產(chǎn)品加工方向）、茶學(xué)（茶藝茶道方向）、機(jī)械設(shè)計(jì)制造及其自動(dòng)化、車(chē)輛工程、農(nóng)學(xué)、水利水電工程、土木工程、植物保護(hù)、園林（高爾夫球場(chǎng)管理方向）、電子信息工程、網(wǎng)絡(luò)工程、水土保持與荒漠化防治、農(nóng)業(yè)資源與環(huán)境、計(jì)算機(jī)科學(xué)與技術(shù)、動(dòng)物科學(xué)、園林、動(dòng)物科學(xué)（飼料科學(xué)與工程方向）、動(dòng)物醫(yī)學(xué)、工業(yè)工程、秘書(shū)學(xué)、動(dòng)物醫(yī)學(xué)（動(dòng)物檢疫方向）、數(shù)學(xué)與應(yīng)用數(shù)學(xué)、信息管理與信息系統(tǒng)、水產(chǎn)養(yǎng)殖學(xué)、農(nóng)村區(qū)域發(fā)展、資源環(huán)境與城市規(guī)劃管理、園藝、農(nóng)林經(jīng)濟(jì)管理、園藝（中荷交流項(xiàng)目）、農(nóng)林經(jīng)濟(jì)管理（特有民族班）、環(huán)境科學(xué)、設(shè)施農(nóng)業(yè)科學(xué)與工程、人文地理與城鄉(xiāng)規(guī)劃、電子商務(wù)、蜂學(xué)、生物技術(shù)、土地資源管理、森林保護(hù)與游憩、資源環(huán)境與城鄉(xiāng)規(guī)劃管理、社會(huì)工作、經(jīng)濟(jì)學(xué)、動(dòng)植物檢疫(植物檢疫方向)、旅游管理、應(yīng)用化學(xué)、社會(huì)體育指導(dǎo)與管理、英語(yǔ)、體育教育。

云南農(nóng)業(yè)大學(xué)其他專(zhuān)業(yè)有8個(gè)：能源與動(dòng)力工程、越南語(yǔ)、公共事業(yè)管理、工程管理、工程造價(jià)、建筑學(xué)、環(huán)境工程、行政管理。