吉首大學總共有55個專業(yè)。

吉首大學本科專業(yè)有47個：食品科學與工程、人力資源管理、法學、歷史學、生物工程、信息管理與信息系統(tǒng)、思想政治教育、網絡工程、臨床醫(yī)學、小學教育、城市規(guī)劃、護理學、食品質量與安全、針灸推拿學、信息與計算科學、植物科學與技術、工商管理、園林、電子信息科學與技術、國際經濟與貿易、電子信息工程、市場營銷、數(shù)學與應用數(shù)學、經濟學、會計學、經濟學、計算機科學與技術、物理學、通信工程、旅游管理、化學、環(huán)境工程、公共事業(yè)管理、應用化學、電子商務、化學工程與工藝、生物科學、文化產業(yè)管理、法學、環(huán)境科學、資源環(huán)境與城鄉(xiāng)規(guī)劃管理、英語、日語、外國語言文學、漢語言文學、新聞學、廣告學。

吉首大學其他專業(yè)有8個：軟件工程、學前教育、土木工程、材料科學與工程、制藥工程、醫(yī)學影像學、教育技術學、統(tǒng)計學。