南京信息工程大學總共有47個專業(yè)。

南京信息工程大學本科專業(yè)有46個：環(huán)境工程、財務管理、數(shù)學與應用數(shù)學、海洋科學、人力資源管理、生態(tài)學、雷電防護科學與技術、電氣信息類（中外）、應用化學、通信工程、物理學、信息工程、統(tǒng)計學、資源環(huán)境與城市規(guī)劃管理、信息管理與信息系統(tǒng)、大氣科學、電子科學與技術、光信息科學與技術、行政管理、環(huán)境科學、日語、計算機科學與技術、電氣工程與自動化、電子信息工程、信息與計算科學、測控技術與儀器、英語、應用氣象學、會計學、網(wǎng)絡工程、漢語言文學、物流管理、材料物理、對外漢語、電氣工程及其自動化、測繪工程、應用物理學、自動化、市場營銷、國際經(jīng)濟與貿(mào)易、軟件工程、公共事業(yè)管理、地理信息系統(tǒng)、遙感科學與技術、法學、資源環(huán)境與城鄉(xiāng)規(guī)劃管理。

南京信息工程大學其他專業(yè)有1個：翻譯。