南京理工大學總共有83個專業(yè)。

南京理工大學本科專業(yè)有72個：材料成型及控制工程、網絡工程、武器系統與工程、彈藥工程與爆炸技術、建筑環(huán)境與設備工程、信息對抗技術、測控技術與儀器、電氣工程及其自動化、熱能與動力工程、電機與電器、工程力學、真空電子技術、電子信息工程、探測制導與控制技術、土木工程、計算機科學與技術、探測制導與測控技術、環(huán)境工程、自動化、高分子材料與工程、納米材料與技術、安全工程、機械工程及自動化、通信工程、生物工程、新能源科學與工程、化學工程與工藝、電氣工程與自動化、輻射防護與環(huán)境工程、國際經濟與貿易、軟件工程、材料科學與工程、金融學、交通工程、工業(yè)設計、電子科學與技術、光電信息工程、武器系統與發(fā)射工程、車輛工程、經濟學、制藥工程、探測制導與控制技術、武器、特種能源工程與煙火技術、經濟學、彈藥工程與發(fā)射工程、電子商務、信息管理與信息系統、社會工作、化學、工業(yè)工程、廣播電視新聞學、工商管理、思想政治教育、藝術設計、市場營銷、英語、法學、法語、數學與應用數學、會計學、信息與計算科學、人力資源管理、應用物理學、電子信息科學與技術、財務管理、光信息科學與技術、公共事業(yè)管理、材料化學、工商管理、材料學、管理科學與工程。

南京理工大學其他專業(yè)有11個：微電子學、機械、日語、統計學、電氣信息、智能電網信息工程、數學、化工與制藥、材料物理、飛行器設計與工程、材料。